畸形精子症是指精子的形态异常，这可能会影响精子的功能，包括它们的运动能力和与卵子结合的能力。
当精子畸形率超过96%时，可能会降低怀孕的概率，但并不意味着一定不能自然怀孕。即使精子畸形率很高，只要精子的顶体完整性较好，尾部畸形不严重，仍然有可能自然受孕。但是，如果精子顶体偏小或是缺失，如圆头精子，尾巴过短或太长，这会严重影响到受孕几率 。
此外，精子畸形率高并不直接导致胎儿畸形或流产。流产和胎儿畸形通常与遗传性因素和环境因素有关，而不是精子的形态 。在自然受孕过程中，卵子通常会选择形态正常的精子进行受精，这是一个自然的筛选过程。
对于精子畸形率偏高的患者，建议采取健康的生活方式，如戒烟、戒酒、避免高温环境（如桑拿）、保持良好的睡眠和饮食习惯，避免接触有毒有害物质。
在备孕超过1年依然不怀孕的情况下，建议积极借助试管婴儿技术助孕，对于畸形精子症的患者，通常采用第二代试管婴儿技术，大致费用5万左右。
